中国水产科学研究院黑龙江所“江鳕基因组资源开发与利用研究”取得重要进展

　　江鳕（Lota lota）是鳕科（Gadidae）唯一的淡水种，广泛分布在北纬45°以北的欧亚和北美的内陆水域或海湾，在中国仅分布于黑龙江水系及鸭绿江上游和新疆的额尔齐斯河，是高寒水域珍稀的经济鱼类。近期，在黑龙江省自然科学基金项目（LH 2019C089, LH2019C070）的资助下，黑龙江水产研究所在“江鳕基因组资源开发与利用研究”中取得重要进展，相关研究成果“Chromosome-Level Genome Assembly of the Burbot （Lota lota） Using Nanopore and Hi-C Technologies”发表于中科院JCR 2区期刊《Frontiers in Genetics》（IF=4.599）（https://doi.org/10.3389/fgene.2021.747552） 。

 

　　该研究组装了一个江鳕的高质量的染色体水平基因组，基因组大小估计为565.64 Mb，杂合度为0.5%，锚定在24条染色体上。共注释得到21,672个蛋白编码基因，构建的系统发育树结果表明江鳕与大西洋鳕鱼（Gadus morhua）的亲缘关系最密切，分化时间约为4,921万年前。

　　江鳕高质量染色体水平的基因组的获得，将为其生物学和进化研究以及遗传改良等提供数据基础，对江鳕基因组资源开发利用，以及自然资源保护、恢复和有效管理具有重要意义。