山东省农业科学院蔬菜研究所在洋葱高密度遗传图谱构建及花薹高度相关SNP鉴定方面取得重要进展

　　近日，山东省农业科学院蔬菜研究所鳞茎类蔬菜育种与栽培创新团队洋葱课题组在Frontiers in Plant Science（IF=6.627；JCR1区，中科院2区）发表了题为“Construction of a high-resolution genetic map and identification of single nucleotide polymorphism markers relevant to flower stalk height in onion”的研究论文。

 

　　洋葱（Allium cepa L.）具有重要的园艺和药用价值，其分布广泛，南北各地均有栽培，是国内主栽蔬菜之一，也是出口创汇的主要蔬菜之一。由于洋葱为二年生植物且其基因组庞大、重复序列较多、遗传背景狭窄等原因，洋葱高密度遗传图谱的构建和基于图谱的基因挖掘工作一直落后于番茄等其他蔬菜作物。

 

　　本研究利用洋葱两个双单倍体（DH-1×DH-17）为亲本构建的F2群体为研究材料，采用SLAF-seq技术构建了洋葱高密度遗传图谱。该遗传图谱全长928.32 cM，平均图距0.09 cM，包含8个连锁群，10,584个多态SLAFs、21,250个SNP标记。利用该图谱，首先对调控雄性可育性状（Ms）的位点进行了QTL定位，定位结果与前人一致，说明该遗传图谱具有较高的质量。其次检测到49个与花薹高度相关的SLAF标记，其中20个SLAFs被认为是花薹高度性状杂种优势的有效有利等位变异标记，可用于后期花薹高度相关基因或KASP标记的开发。本研究中构建的高质量高密度洋葱连锁图谱为洋葱花薹高度等重要农艺性状的精细定位和候选基因鉴定奠定了基础，也为洋葱育种发育遗传机制的研究提供了新思路。

 

　　蔬菜研究所李艳伟博士为该论文第一作者，吴雄研究员和刘冰江研究员为该论文的共同通讯作者。该研究得到了国家蔬菜产业技术体系和山东省农业科学院农业科技创新工程的资助。原文链接：https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2023.1100691/full（撰稿：李艳伟，核稿：王凤德）